Elle a été organisée par arrêté n° 0485/MF/SG/DEP du 08 décembre 2018. Elle comprend cinq divisions :
- Le Bureau Administratif et Financier.
- Le Secrétariat de la Direction.
- La Division Programmation qui comprend le Service Appui aux directions et, Perfectionnement des cadres et le Service Programmation des Investissements.
- La Division Etudes Générales qui comprend le Service Dossiers Bilatéraux, Multilatéraux et Nationaux et le Service d’Analyse et de la Documentation.
- La Division Suivi et Évaluation qui comprend le Service suivi et évaluation des projets et programmes et le Service Coopération Technique.